Эркин Мухитдинов появился на свет в 1976 году в Андижанской области. В 1997 году он завершил обучение в Андижанском государственном институте экономики и управления (бакалавр), в 2000 году – в Банковско-финансовой академии, а в 2007 году – в японской Высшей школе Института развивающихся экономик.
Мухитдинов занимал разные позиции в Национальном банке внешнеэкономической деятельности, «Туронбанке» и Центральном банке.
С 2017 по 2022 годы он исполнял обязанности первого заместителя министра занятости и трудовых отношений Узбекистана. В 2022-2023 годах занимал пост заместителя министра занятости и сокращения бедности.
Напоминаем, что 15 октября он был освобождён от должности первого заместителя хокима Ташкентской области по вопросам финансов, экономики и сокращения бедности. Тогда глава государства выразил недовольство по поводу выполненной работы в данной сфере. В декабре 2024 года ему было поручено руководство департаментом политики лесного хозяйства, биоразнообразия и экотуризма.